商标转让协议是双方在商标转让过程中达成的具有法律效力的文件。在协议中，对于商标的侵权问题，双方应明确约定处理方式，以保障双方的合法权益。以下将从多个方面对商标侵权问题的处理进行详细阐述。

二、明确侵权定义

在协议中应明确界定侵权的概念。双方应共同定义何为商标侵权行为，包括但不限于未经许可使用相同或近似商标、假冒注册商标、擅自转让商标等。

三、侵权责任划分

协议中应明确约定，一旦发生侵权行为，责任方应承担何种法律责任。包括但不限于停止侵权行为、赔偿损失、消除影响等。

四、侵权行为通知

一旦发现侵权行为，受让方应及时通知转让方，并提供相关证据。转让方应在接到通知后，立即采取必要措施，制止侵权行为。

五、侵权纠纷解决途径

协议中应明确约定，一旦发生侵权纠纷，双方应通过何种途径解决。常见的解决途径包括协商、调解、仲裁、诉讼等。

六、侵权赔偿标准

协议中应明确约定，一旦发生侵权行为，赔偿金额的计算标准。赔偿金额应包括但不限于直接损失、间接损失、合理费用等。

七、侵权证据收集

协议中应明确约定，双方在发现侵权行为时，应如何收集证据。包括但不限于拍照、录像、取证等。

八、侵权行为制止措施

协议中应明确约定，一旦发生侵权行为，双方应采取何种措施制止侵权。包括但不限于警告、停止侵权、赔偿损失等。

九、侵权行为后续处理

协议中应明确约定，一旦发生侵权行为，双方应如何处理后续事宜。包括但不限于恢复名誉、消除影响、赔偿损失等。

十、侵权责任承担期限

协议中应明确约定，侵权责任承担的期限。通常情况下，侵权责任承担期限为自侵权行为发生之日起两年。

十一、侵权行为披露义务

协议中应明确约定，一旦发生侵权行为，双方有义务向相关部门披露，包括但不限于商标局、工商局等。

十二、侵权行为保密义务

协议中应明确约定，双方在处理侵权行为过程中，有义务对相关信息进行保密。

十三、侵权行为后续跟踪

协议中应明确约定，双方在处理侵权行为后，应如何进行后续跟踪，以确保侵权行为不再发生。

十四、侵权行为预防措施

协议中应明确约定，双方应采取何种预防措施，以避免侵权行为的发生。

十五、侵权行为法律适用

协议中应明确约定，侵权行为的法律适用，包括但不限于《商标法》、《反不正当竞争法》等。

十六、侵权行为争议解决机构

协议中应明确约定，侵权行为争议解决机构，如仲裁委员会、法院等。

十七、侵权行为争议解决程序

协议中应明确约定，侵权行为争议解决程序，包括但不限于申请、审理、执行等。

十八、侵权行为争议解决费用

协议中应明确约定，侵权行为争议解决费用，包括但不限于律师费、仲裁费、诉讼费等。

十九、侵权行为争议解决期限

协议中应明确约定，侵权行为争议解决期限，以确保争议得到及时解决。

二十、侵权行为争议解决结果

协议中应明确约定，侵权行为争议解决结果，包括但不限于赔偿金额、恢复名誉、消除影响等。

上海加喜财税公司服务见解

上海加喜财税公司作为专业的公司转让平台，深知商标转让协议中处理侵权问题的重要性。我们建议，在签订商标转让协议时，双方应充分沟通，明确约定侵权问题的处理方式，以保障双方的合法权益。我们提供以下服务：

1. 协助双方进行商标侵权风险评估；

2. 提供专业的法律咨询，确保协议条款的合法性和有效性；

3. 协助双方进行侵权行为调查和取证；

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5. 协助双方进行侵权赔偿金额的评估和计算；

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